1.4.2 . Hệ động vật

- Hệ thống các VQG của vùng như : VQG Tràm Chim ( Đồng Tháp ), VQG U Minh Thượng ( Kiên Giang ), U Minh Hạ( Cà Mau ) , Phú Quốc , Mũi Cà Mau.

- Hệ động vật ở ĐBSCL gồm 10 loài bò sát 23 loài có vú, 386 loài và bộ chim, 6 loài lưỡng cư và 260 loài cá. Đặc biệt trong số đó các quý hiếm nằm trong sách đỏ Việt Nam loài Rái cá lông mượt ,rái cá vuốt bé , cầy giông, Mèo cá, rắn hổ mang chúa , trăn đất , Tắc kè.

- ĐBSCL là một vùng trú đông quan trọng đặc biệt đối với các loài chim di trú trong những năm gần đây, bảy khu vực sinh sản lớn của các loài diệc , cò trắng ,công đất , vạc, Cốc đế , đã được phát hiện trong các khu rừng tràm, loài Sếu đầu đỏ phương Đông, gần đây đã được phát hiện ở huyện Tam Nông trong Đồng Tháp Mười. Trong khu bảo tồn Tràm Chim có 92 loài chim đã được xác định. Trong vùng rừng U Minh, có 81 loài chim đã được ghi nhận.

Sếu đầu đỏ

+ Một loài chim quí hiếm, nằm trong sách đỏ Việt Nam, có nguy cơ tuyệt chủng. Vào mỗi đầu mùa khô, Sếu đầu đỏ bay đến từ bắc Campuchia và các khu rừng khộp Tây nguyên xuống các rừng ngập nước ở phía nam như Tràm Chim, Hòn Chông (Kiên Lương) và biển Hồ Tonle Sap. Hiện nay còn khoảng 300 sếu đầu đỏ thường lui tới mỗi năm các vùng ngập nước ở Tràm Chim, Kiên Lương

+ Những vùng ngập nước ở ĐBSCL cũng là nơi cư trú của các loài bò sát và động vật lưỡng cư. Nhiều loài động vật có vú, chim, bò sát và động vật lưỡng cư bị đánh bắt phục vụ cho nhu cầu tiêu dùng.

Theo Trung tâm Quốc gia Giống thủy sản nước ngọt Nam bộ, ĐBSCL có trên 250 loài cá nước ngọt, trong đó khoảng 50 loài có giá trị kinh tế cao và khoảng gần 20 loài cá quý hiếm.