Les Pokémon légendaires sont classés tout d'abord selon leur niveau de dangerosité :

Docile (Keldeo, Marshadow, Cobaltium Viridium) : Le légendaire accepte de prêter main forte a son Élu sans préambule 

Neutre (Lunala, Xerneas, Victini, Tokopisco) : Le légendaire accepte de prêter main forte à l'Élu si celui ci prouve sa valeur

Incontrôlable : Le légendaire doit être soumis par la force. (Classe 1, 2, 3 ou 4)

Ensuite il y'a les classes par rapport à leur niveau dans la hiérarchie des divinités 

Divinité Créatrice : Arceus

Divinité Destructrice : Giratina

Divinités primordiales : Dialga, Palkia, Crefollet, Crefadet, Créhelf

Divinités globales : Necrozma, Xerneas, Yveltal

Divinités Terrestres : Groudon, Kyogre, Rayquaza, Zygarde, Solgaleo, Lunala, Ho-Oh, Lugia, Mew

Divinités Spirituelles : Cresselia, Darkrai, Shaymin, Manaphy, Meloetta, Victini

Le reste des légendaires sont soit des Divinités Secondaires, soit des divinités locales.