Sau khi được Madara cứu sống , Obito đã có một khoảng thời gian ở cạnh Madara , được Madara chỉ đạo truyền dạy nuôi nấng . Một hôm Madara hỏi Obito

_ngươi có muốn cùng ta hủy hoại thế giới này không?

_Hủy hoại thế giới sao?

_Phải , dù sao thì ngươi cũng thấy đó , cái thế giới này luôn có sự phân biệt , ganh ghét , căm thù , đố kị , chi bằng chúng ta đập nát chúng rồi xây dựng lại 1 thế giới khác hả? - Madara chơi đòn chiến thuật để nhằm thuyết phục Obito

_Dù sao thì không phải người ngươi yêu nhất đã bị thế giới này giết chết sao? Chi bằng ngươi tự tay phá hủy thế giới này để trả thù cho người ngươi yêu? - Madara thật sự khá khôn khéo khi lấy Rin ra làm mồi nhử Obito

_Tôi cần một chút thời gian...thưa ông - Obito có phần hơi do dự , dù sao thì cái lý tưởng xây dựng thế giới hòa bình bằng tình yêu thương vẫn luôn ăn sau vào lòng cậu , nếu bây giờ đập nát thế giới bằng chiến tranh , thì sau đó sẽ nhận lại được gì chứ?

Tuy nghĩ như vậy nhưng cậu vẫn không nói ra cho Madara . Và sau rất nhiều đắng đo , cậu cũng giữ vững kiên định , cậu sẽ xây dựng thế giới này theo hướng hòa bình thay vì chiến tranh . Nhân lúc Madara đi vắng , cậu đã lén lút rời khỏi hang động

Cậu cố gắng tìm đường trở về Làng Lá , đã 2 năm rồi cậu không biết Làng ra sao , thầy Minato như thế nào....và còn cả....Kakashi . Nghĩ đến Kakashi , Obito lại cảm thấy một cảm giác khó chịu nảy ra từ lòng ngực mình , hắn nhớ đến cái cảnh thấy Kakashi đâm chết Rin , những cảnh tưởng đau thương đẩm máu cứ liên tục ào ạt hiện ra trong đầu hắn .

- Mẹ kiếp , Kakashi - Obito đột nhiên ngừng lại đấm vào cái cây bên cạnh

_Ta phải giết chết ngươi , tên khốn Kakashi

Lúc Obito trở về làng , anh đã chạy đến văn phòng Hokage tìm thầy mình . Khi thấy Obito , Minato không khỏi vui mừng vì cậu vẫn còn sống. Sau một hồi nói chuyện thì Obito chợt hỏi về Kakashi

_Thầy à , tại sao Kakashi lại đâm Rin chết vậy thầy ?

_Obito , đó không phải là Kakashi đâm , mà là Rin đã lao vào đòn Chidori , lao vào để hy sinh cứu làng . Con bé là một nữ anh hùng - Minato giải thích

_Vậy sao thầy?

_Phải , đây là sự thật , Kakashi không hề đâm chết Rin đâu

_Thầy à , còn bọn ninja khốn khiếp làng Sương Mù đó đã tóm hết được chưa thầy

_Ừm , thầy không biết , nhưng khi ninja của Làng lá đến để bắt lũ ninja đó thì chỉ thấy họ đã chết

Thật ra chính Obito đã tự tay giết chết bọn họ . Phải , chính cậu điên loạn giết chết bọn họ để trả thù cho Rin - người con gái cậu yêu . Nhưng cậu vẫn giả vờ hỏi Minato để thăm dò tình hình

Mục tiêu bao lâu của cậu là tiêu diệt làng sương mù và giết chết Kakashi để trả thù cho Rin . Nhưng khi nghe được sự thật , cậu lại cảm thấy không muốn giết Kakashi nữa , nhưng chỉ là để tha thứ cho Kakashi , thì Obito không làm được.

_vậy thì giờ cậu ta ở đâu?

_Kakashi à? Thằng bé đã lên đường đi du hành cùng sư phụ Jiraiya rồi

_Du hành sao?

_Phải , thằng bé đã đi du hành rồi

"Giết chết Rin rồi mà còn có tâm trạng đi du hành sao , ta cảm thấy ngươi bây giờ không khác gì rác rưởi cả , Kakashi"

_Này , Obito , em bị gì vậy hả?

_À không thầy , em không sao

_Chắc là em cũng mệt rồi , em về nghỉ ngơi đi , thầy đã sắp xếp chỗ ở cho em rồi

_Dạ được thầy , cảm ơn

Obito đã biết hết mọi chuyện , đó không phải lỗi của Kakashi , nhưng khi nghe nói Kakashi có thể bỏ qua mọi chuyện mà đi du hành cùng Jiraiya thì lửa hận thù lại sôi lên , Obito không thể ngừng tức giận khi nghĩ đến điều đó .

Không lâu sau đó , Cửu Vĩ mất kiểm soát tấn công làng , Minato cùng Kushina đã hy sinh để bảo vệ làng và phong ấn Cửu Vĩ , lúc này Obito tuy có giúp nhưng cũng không thể nào tránh khỏi tan thương hy sinh của 2 vợ chồng thầy mình . Lúc này Obito lại thêm căm hận Kakashi , tại sao Kakashi có thể thong thả đi du hành , để thầy mình phải đối mặt với Cửu Vĩ , thiên tài Hatake Kakashi mà mọi người ca tụng thật ra chỉ là một thứ rác rưởi , bỏ thầy bỏ bạn. Obito quyết , nếu một ngày tìm được Kakashi ,anh quyết tâm sẽ khiến Kakashi đau khổ , sống không bằng chết

Nhưng cậu không hề biết rằng , Jiraiya đã nhận được tin Làng Lá có biến , nhưng vào thời điểm đó , Kakashi lại bị sốt rét , sốt đến nỗi úng cả não . Với tình hình như vậy , Jiraiya đành chọn cách không nói gì cho kakashi biết , ông giao Kakashi lại cho dân làng gần đó săn sóc , tình hình của Kakashi thật sự rất tệ , nếu mang theo sẽ là gánh nặng thay vì hữu ích . Jiraiya chọn quay trở về làng một mình , nhưng khi quay về thì đã muộn rồi . Minato người ông học trò yêu quý của ông đã hy sinh trong cuộc chiến với Cửu Vĩ , ông quá đau buồn , nhưng sau đó ông đã lấy lại được lý trí , quay trở về với Kakashi , ông mong Kakashi sẽ không sao , dù sao mất đi Minato đã quá đủ rồi , ông hy vọng khi trở về Kakashi sẽ không sao.

Và thật may là sau khi trở về tình trạng của Kakashi đã có tiến triển , anh đã hôn mê khá lâu , nhưng lúc ông trở về thì Kakashi đã tỉnh dậy , chỉ là người anh còn yếu , ông không vội nói chuyện của Minato cho Kakashi biết . Ông nghĩ đợi cậu bình phục hẳn rồi ông sẽ nói