A grande batalha pelo destino do Império continua com grupos de Armas Imperiais lutando entre si. Os Jaegers defendendo o país que por anos prosperou enquanto a Night Raid buscava derrubar aquele país para livrar o povo da corrupção. Contudo, após uma súbita traição contra ambos os lados, as equipes descobrem que a corrupção é bem mais profunda do que sabiam.

Após súbitas descobertas da substituição dos Jaegers por outro grupo de usuários de Armas Imperiais corruptos, o desaparecimento de Esdeath, o golpe do Exército Revolucionário contra a Night Raid e muito mais, os dois lados traídos se vêem obrigados a deixarem suas diferenças de lado e agirem juntos para sobreviver a essa guerra aparentemente sem fim, e livrar o país inteiro da corrupção que inundou suas vidas.